История Университета начинается с 1906 года. Тогда под влиянием прогрессивной общественности были организованы Московские женские курсы. Затем курсы преобразовали во 2-й Московский государственный университет, из которого в 1930 году выделился самостоятельный 2-й Московский государственный медицинский институт, получивший в 1956 году имя великого русского хирурга и анатома Николая Ивановича Пирогова.
Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова — крупнейший центр медицинского образования и науки, признанный на мировом уровне. Здесь готовят врачей, педиатров, стоматологов, специалистов в области фармации, психологии, социальной работы, а также исследователей, специализирующихся по медицинской биохимии, кибернетике и биофизике.
В РНИМУ имени Н.И. Пирогова реализуются программы довузовской подготовки, бакалавриата и специалитета, магистратуры, ординатуры, аспирантуры, а также программы ДПО.
РНИМУ успешно развивает международное сотрудничество.
Действует программа 2-х дипломов с Миланским Университетом по специальности «Лечебное дело». Ведутся совместные исследования с крупными зарубежными биомедицинскими центрами.
В структуре вуза действуют: НИКИ педиатрии им. академика Ю.Е. Вельтищева и Российский геронтологический научно-клинический центр. Есть собственный симуляционный центр для обучения по программам «Неотложные состояния в педиатрии», «Новые перинатальные технологии», «Эндохирургия», обеспеченный современным оборудованием, а также российская детская клиническая больница.
РНИМУ имени Н.И. Пирогова является головной организацией Московского кластера медицинских технологий «Южный», объединяющего более 20 научных и производственных организаций для координации усилий по развитию новых медицинских технологий и их внедрению в практическое здравоохранение на принципах трансляционной медицины, и координатором Восточно-Европейского научно-образовательного медицинского кластера.
В университете функционирует единая информационная образовательная среда, поддерживающая обучение с применением дистанционных технологий.
Сейчас в ВУЗе обучается более 9000 студентов, в том числе из стран дальнего зарубежья.
В 2010 году Университет, единственный среди медицинских вузов России, получил статус "Национальный исследовательский университет".
РНИМУ им. Н.И. Пирогова входит в список лучших медицинских вузов России. В 2018 году стал лидером в рейтинге востребованности среди медицинских вузов России.
8 факультетов, 135 кафедр.
В вузе созданы все условия для внеучебной работы с иностранными студентами.
Располагает спортивным комплексом и учебно-спортивно-оздоровительным комплексом «Конаково».
Университет располагает 4 общежитиями для комфортного проживания и всестороннего развития иностранных студентов.